Säkerhetsledningssystemet (Eng. Safety Management System, SMS) är en viktig del av ISM-koden och innehåller samtliga grundläggande policys, förfaranden och rutiner som bör följas för att garantera säker framdrivning och användande av fartyg till sjöss. SMS säkerställer att varje fartyg överensstämmer med de säkerhetsregler och föreskrifter som finns. Med tillåtelse av ägaren till m/s Shamrock presenterar Stiftelsen Maritimt Kulturarv (SMK) på sin hemsida som ett bra exempel Shamrocks SMS. Dokumentet återfinns under rubriken Organisation.